begin process at 2010 09 04 17:30:59
  Trouver un code source :
 
dans
 
Accueil > 

Code

 > 

Divers

 > CALCUL MIX PCR

CALCUL MIX PCR


 Information sur la source

Note :
Aucune note
Catégorie :Divers Classé sous :calcul, biologie, moléculaire, PCR, Mix Niveau :Débutant Date de création :27/11/2008 Date de mise à jour :08/03/2010 14:18:49 Vu / téléchargé :2 508 / 34

Auteur : PYLostMan

Ecrire un message privé
Commentaire sur cette source (0)
Ajouter un commentaire et/ou une note

 Description

Ce petit programme permet aux biologistes moléculaire de Calculer leur mix PCR sans la moindre difficulté. Il suffit d'entrer le nombre d'échantillons et/ou quelques paramètres spécifiques pour voir le calcul détaillé s'afficher!

Source

  • #!/usr/bin/python
  • # -*- coding: utf-8 -*-
  • #code source python mix PCR
  • print "Ce programme vous permet de calculer vos mix PCR"
  • print "Voulez-vous utiliser les options par défaut? (o/n)"
  • choix=raw_input()
  • if choix=="o":
  • print "Le calcul se fait sur base d'une réaction dans 25µl avec 2,5µl d'échantillon"
  • print "Les réactions sont considérées avec de la taq DNA Polymérase classique"
  • print "Entrez le nombre d'échantillons"
  • i = raw_input()
  • n=int(i)
  • s=n/10
  • s=int(s)
  • tot= n+s+1
  • print "Vous avez donc", n, "échantillons + ", s ,"sécurités et 1 blanco"
  • print "Soit",tot,"échantillons."
  • print "Calcul:"
  • print""
  • print "Amorce F: 0.5µl x ", tot, " = ", tot*0.5,"µl"
  • print "Amorce R: 0.5µl x ", tot, " = ", tot*0.5,"µl"
  • print "Buffer : 2.5µl x ", tot, " = ", tot*2.5,"µl"
  • print "Taq : 0.25µl x ", tot, " = ", tot*0.1,"µl"
  • print "H20 :18.75µl x ", tot, " = ", tot*18.9,"µl"
  • print ""
  • print "soit 22,5µl par tube PCR + 2.5µl d'échantillon"
  • raw_input()
  • elif choix == "n":
  • print "choisissez le volume d'échantillon à ajouter"
  • ench= raw_input()
  • ech=float(ench)
  • print "Choisissez le volume réactionnel"
  • voln=raw_input()
  • vol=float(voln)
  • am=vol/50
  • buf=vol/10
  • taq=vol/100
  • eau=vol-am-am-buf-taq-ech
  • print "Quel est le nombre d'échantillons?"
  • nn=raw_input()
  • n=int(nn)
  • s=n/10
  • tot=n+s+1
  • amt=am*tot
  • buft=buf*tot
  • taqt=taq*tot
  • eaut=eau*tot
  • volm=(amt+amt+buft+taqt+eaut)/tot
  • print "Vous avez donc",n, "échantillons + ",s,"sécurités et 1 blanco"
  • print "Soit",tot,"échantillons"
  • print "Calcul"
  • print""
  • print "Amorce F: ", am,"µl x ", tot, " = ",amt,"µl"
  • print "Amorce R: ", am,"µl x ", tot, " = ", amt,"µl"
  • print "Buffer : ",buf,"µl x ", tot, " = ",buft,"µl"
  • print "Taq : ",taq, "µl x ", tot, " = ",taqt,"µl"
  • print "H20 : ",eau,"µl x", tot, " = ", eaut,"µl"
  • print""
  • print "Soit",volm,"µl par tube PCR"
  • raw_input()
  • else:
  • print"erreur"
#!/usr/bin/python
# -*- coding: utf-8 -*-
#code source python mix PCR



print "Ce programme vous permet de calculer vos mix PCR"
print "Voulez-vous utiliser les options par défaut? (o/n)"
choix=raw_input()
if choix=="o":
    print "Le calcul se fait sur base d'une réaction dans 25µl avec 2,5µl d'échantillon"

    print "Les réactions sont considérées avec de la taq DNA Polymérase classique"

    print "Entrez le nombre d'échantillons"

    i = raw_input()

    n=int(i)

    s=n/10

    s=int(s)

    tot= n+s+1

    print "Vous avez donc", n, "échantillons + ", s ,"sécurités  et 1 blanco"

    print "Soit",tot,"échantillons."
    print "Calcul:"
    print""
    print "Amorce F:  0.5µl x ", tot, " = ", tot*0.5,"µl"
    print "Amorce R:  0.5µl x ", tot, " = ", tot*0.5,"µl"
    print "Buffer  :  2.5µl x ", tot, " = ", tot*2.5,"µl"
    print "Taq     : 0.25µl x ", tot, " = ", tot*0.1,"µl"
    print "H20     :18.75µl x ", tot, " = ", tot*18.9,"µl"
    print ""
    print "soit 22,5µl par tube PCR + 2.5µl d'échantillon"
    raw_input()

elif choix == "n":
    print "choisissez le volume d'échantillon à ajouter"
    ench= raw_input()
    ech=float(ench)
    print "Choisissez le volume réactionnel"
    voln=raw_input()
    vol=float(voln)
    am=vol/50
    buf=vol/10
    taq=vol/100
    eau=vol-am-am-buf-taq-ech
    print "Quel est le nombre d'échantillons?"
    nn=raw_input()
    n=int(nn)
    s=n/10
    tot=n+s+1
    amt=am*tot
    buft=buf*tot
    taqt=taq*tot
    eaut=eau*tot
    volm=(amt+amt+buft+taqt+eaut)/tot
    print "Vous avez donc",n, "échantillons + ",s,"sécurités et 1 blanco"
    print "Soit",tot,"échantillons"
    print "Calcul"
    print""
    print "Amorce F: ", am,"µl x ", tot, " = ",amt,"µl"
    print "Amorce R: ", am,"µl x ", tot, " = ", amt,"µl"
    print "Buffer  : ",buf,"µl x ", tot, " = ",buft,"µl"
    print "Taq     : ",taq, "µl x ", tot, " = ",taqt,"µl"
    print "H20     : ",eau,"µl x", tot, " = ", eaut,"µl"
    print""
    print "Soit",volm,"µl par tube PCR"
    raw_input()
else:
	print"erreur"
    

 Conclusion

A faire:
* réécriture du code pour le rendre plus robuste,
*diversifier le type de réaction


merci pour vos avis

 Fichier Zip

Les Membres Club peuvent télécharger directement un fichier contenu dans le zip sans télécharger le zip en entier !

Télécharger le zip


 Historique

27 novembre 2008 23:03:20 :
modif de la capture
27 novembre 2008 23:04:11 :
modif de la capture
30 novembre 2008 16:13:17 :
planning
30 novembre 2008 16:14:43 :
objectifs de développement
08 mars 2010 14:18:49 :
capture erronée, effacement de la capture

 Sources de la même categorie

Source avec Zip SCRIPT PERMETTANT DE DÉCODER LA STRUCTURE SECONDAIRE D'UNE P... par Basilio
SUPPRESSION par Rano Its
Source avec Zip RECONNAISSANCE VOCALE par brennal
CONVERTISSEUR DE TEMPÉRATURE par skizo00o
Source avec Zip Source avec une capture I.A. (DÉBUTANT) par Rano Its

 Sources en rapport avec celle ci

Source avec Zip Source avec une capture DIVISIONS AVEC PRÉCISION RÉGLABLE par Clempython
Source avec Zip Source avec une capture LE CALCULATOR DE RAYGOLD VERSION 3.1 par raygold
SIMPLE COMPARATEUR IPV4 EN PYTHON par erebos
Source avec Zip Source avec une capture CALCUL DE RÉSISTANCES par amaury74
Source avec Zip Source avec une capture LE COMPTE EST BON par PythonLin

Commentaires et avis

Aucun commentaire pour le moment.

 Ajouter un commentaire


Discussions en rapport avec ce code source dans le forum

calcul matriciel [ par evelockertrue ]  salut,j'ai pour projet de développer un package contenant des fonctions ècrites en python et qui serviront à optimiser le ca calcul matriciel simple [ par gwenc_hlan ] bonjour,    comment peut on faire sous Python du calcul matriciel simple ? (additionner, multiplier ou inverser des matrices). faut - il impérativeme Problème de calcul simple [ par vaggarath ] Bonjour bonjour. Voilà j'ai un problème tout c*n, j'en suis sur... En fait je fais un boutton qui procède à un calcul suivant les valeurs rentrées au


Nos sponsors


Sondage...

Comparez les prix

CalendriCode

Septembre 2010
LMMJVSD
  12345
6789101112
13141516171819
20212223242526
27282930   

Consulter la suite du CalendriCode

 
Développement réalisé par Nicolas SOREL (Nix) avec l'aide de : Cyril DURAND et Emmanuel (EBArtSoft), Merci à Vincent pour ses précieux conseils.
CodeS-SourceS.com© Toute reproduction même partielle est interdite sauf accord écrit du Webmaster
CodeS-SourceS.com© est une marque déposée tous droits réservés

Google Coop CodeS-SourceS Google Coop CodeS-SourceS
Temps d'éxécution de la page : 0,655 sec (4)

Nous contacter | Annoncer sur CodeS-SourceS | Mentions légales